Dès l'âge de 14 ans, il fonde son premier groupe, Inearthed avec son grand ami Jaska Raatikainen en 1993. À 16 ans, il décroche de l'école et se concentre pleinement à la guitare et la composition. Inearthed est principalement du death metal assez lourd et Alexi s'occupe de la voix (il s'inspire principalement de Philip Anselmo de Pantera et de Mille Petrozza de Kreator) et de la guitare principale, ce qui déjà, confirme son grand talent. Mais en 1996, le jeune groupe décide d'évoluer le style death metal en y introduisant un clavier. Janne Wirman, un autre ami d'Alexi entre ainsi dans la formation. Avec Children of Bodom, Alexi compose désormais de la musique très mélodique. Il est le chanteur principal, guitariste, soliste et compositeur de toutes les chansons du groupe finlandais. En 1999 Alexi s'est engagé dans une rivalité avec le talentueux Jani Liimatainen du groupe Sonata Arctica, les 2 groupes se suivront comme rivaux finnois. En 2002, il se fait voler ses guitares Jackson, auquelles il était très attachées. Alexi est aujourd'hui considéré comme l'une des futures légendes de la guitare. Il est aussi le leader du groupe Sinergy et d'un groupe punk qu'il a fondé, Kylähullut, mais dans lequel il ne s'investit pas beaucoup, Children of Bodom lui prenant le plus clair de son temps.
En 1999, Kimberley Goss(ex-Dimmu Borgir) et Jesper Strömblad (In Flames,Dimension Zero) le recrute pour former le groupe Sinergy. Après le déménagement de Kimberley en Finlande, le groupe se dissout mais se reforme plus tard et est constitué de membres finlandais seulement. Le remplaçant de Strombläd est Roope Latvala, qui est devenu en 2003 le deuxième guitariste de Children of Bodom.
Alexi Laiho a les lettres "HATE" d'écrit sur les doigts de la main droite et "COBHC" tatouées sur les doigts de la main gauche (qui signifie: Children Of Bodom Hate Crew), ce que plusieurs passionnés du groupe reproduiront.
Il utilisait auparavant des guitares de marque Jackson (modèle Randy Rhoads). En janvier 2003, ESP Guitars a annoncé la sortie d'une ligne de modèles signatures Alexi Laiho. Il est depuis endorsé par ESP, ainsi que Roope Latvala, deuxième guitariste de Children of Bodom.